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UT2A a mis en place depuis 2010 un environnement qualité basé sur le référentiel des Bonnes Pratiques de Laboratoire et de Fabrication (BPL/BPF). Les BPF constituant un système qualité applicable à tous les secteurs d’activité, elles ont été mises en place au sein d’UT2A par diverses actions concrètes telles que la rédaction d’un manuel d’assurance qualité, la traçabilité des échantillons, des analyses et des résultats, le contrôle métrologique du matériel de laboratoire.